Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms