Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2LP62875 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms