Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL23P62829 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL23P62829 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL23P62829 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL23P62829 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL23P62829 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL23P62829 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL23P62829 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL23P62829 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL23P62829 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL23P62829 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL23P62829 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPL23P62829 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPL23P62829 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL23P62829 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL23P62829 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL23P62829 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL23P62829 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms