Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD3P62318 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms