Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPFP62306 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms