Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMO4P61968 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMO4P61968 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMO4P61968 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMO4P61968 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMO4P61968 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMO4P61968 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMO4P61968 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMO4P61968 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMO4P61968 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMO4P61968 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMO4P61968 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LMO4P61968 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMO4P61968 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMO4P61968 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO4P61968 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO4P61968 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO4P61968 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO4P61968 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO4P61968 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LMO4P61968 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms