Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms