Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCD1P59942 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms