Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMDP57764 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMDP57764 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms