Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRG3P56975 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRG3P56975 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NRG3P56975 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRG3P56975 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRG3P56975 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRG3P56975 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRG3P56975 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRG3P56975 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG3P56975 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG3P56975 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG3P56975 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG3P56975 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG3P56975 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG3P56975 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG3P56975 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG3P56975 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG3P56975 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG3P56975 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG3P56975 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG3P56975 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms