Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms