Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF10P55107 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF10P55107 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF10P55107 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF10P55107 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF10P55107 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF10P55107 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF10P55107 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF10P55107 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF10P55107 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF10P55107 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF10P55107 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF10P55107 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF10P55107 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF10P55107 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF10P55107 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF10P55107 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF10P55107 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF10P55107 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF10P55107 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF10P55107 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF10P55107 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF10P55107 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF10P55107 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF10P55107 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF10P55107 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF10P55107 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF10P55107 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF10P55107 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF10P55107 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms