Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC12A2P55011 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A2P55011 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms