Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GYS2P54840 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GYS2P54840 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GYS2P54840 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GYS2P54840 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GYS2P54840 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GYS2P54840 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GYS2P54840 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GYS2P54840 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GYS2P54840 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GYS2P54840 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYS2P54840 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GYS2P54840 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GYS2P54840 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GYS2P54840 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GYS2P54840 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GYS2P54840 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GYS2P54840 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYS2P54840 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYS2P54840 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYS2P54840 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GYS2P54840 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYS2P54840 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYS2P54840 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GYS2P54840 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYS2P54840 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYS2P54840 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms