Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMTNP53814 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMTNP53814 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMTNP53814 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMTNP53814 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMTNP53814 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMTNP53814 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMTNP53814 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMTNP53814 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMTNP53814 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMTNP53814 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMTNP53814 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMTNP53814 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMTNP53814 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMTNP53814 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMTNP53814 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMTNP53814 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMTNP53814 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMTNP53814 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMTNP53814 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMTNP53814 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMTNP53814 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMTNP53814 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMTNP53814 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMTNP53814 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMTNP53814 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMTNP53814 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMTNP53814 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMTNP53814 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMTNP53814 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMTNP53814 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMTNP53814 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMTNP53814 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMTNP53814 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMTNP53814 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMTNP53814 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMTNP53814 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMTNP53814 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMTNP53814 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMTNP53814 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMTNP53814 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMTNP53814 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMTNP53814 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMTNP53814 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMTNP53814 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNP53814 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNP53814 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNP53814 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNP53814 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNP53814 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNP53814 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNP53814 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMTNP53814 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMTNP53814 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNP53814 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNP53814 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNP53814 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNP53814 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNP53814 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNP53814 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms