Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC5A3P53794 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms