Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRYBA4P53673 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRYBA4P53673 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms