Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms