Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms