Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP98P52948 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP98P52948 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP98P52948 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP98P52948 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP98P52948 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP98P52948 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP98P52948 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP98P52948 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP98P52948 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP98P52948 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP98P52948 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP98P52948 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP98P52948 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP98P52948 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP98P52948 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP98P52948 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP98P52948 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP98P52948 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP98P52948 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP98P52948 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP98P52948 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP98P52948 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP98P52948 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP98P52948 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP98P52948 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP98P52948 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP98P52948 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP98P52948 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP98P52948 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP98P52948 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP98P52948 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP98P52948 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP98P52948 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP98P52948 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP98P52948 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP98P52948 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP98P52948 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP98P52948 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP98P52948 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP98P52948 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP98P52948 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP98P52948 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP98P52948 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP98P52948 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP98P52948 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP98P52948 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP98P52948 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP98P52948 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP98P52948 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP98P52948 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP98P52948 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP98P52948 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP98P52948 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP98P52948 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP98P52948 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP98P52948 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP98P52948 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP98P52948 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP98P52948 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms