Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SMARCA2P51531 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms