Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms