Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms