Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK8P49336 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK8P49336 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK8P49336 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK8P49336 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK8P49336 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK8P49336 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK8P49336 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK8P49336 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK8P49336 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK8P49336 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK8P49336 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK8P49336 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK8P49336 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK8P49336 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK8P49336 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK8P49336 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK8P49336 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK8P49336 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK8P49336 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK8P49336 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK8P49336 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK8P49336 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK8P49336 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK8P49336 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK8P49336 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK8P49336 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK8P49336 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms