Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms