Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NESP48681 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NESP48681 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NESP48681 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NESP48681 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NESP48681 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NESP48681 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NESP48681 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NESP48681 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
NESP48681 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
NESP48681 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NESP48681 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NESP48681 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NESP48681 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
NESP48681 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NESP48681 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NESP48681 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NESP48681 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NESP48681 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
NESP48681 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NESP48681 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NESP48681 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NESP48681 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NESP48681 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NESP48681 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NESP48681 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NESP48681 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NESP48681 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NESP48681 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NESP48681 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NESP48681 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NESP48681 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NESP48681 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NESP48681 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NESP48681 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NESP48681 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
NESP48681 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NESP48681 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NESP48681 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NESP48681 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NESP48681 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NESP48681 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
NESP48681 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NESP48681 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NESP48681 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NESP48681 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NESP48681 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NESP48681 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
NESP48681 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NESP48681 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NESP48681 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NESP48681 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NESP48681 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NESP48681 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NESP48681 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
NESP48681 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NESP48681 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NESP48681 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NESP48681 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NESP48681 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NESP48681 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NESP48681 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NESP48681 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NESP48681 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NESP48681 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NESP48681 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NESP48681 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms