Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXRGP48443 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXRGP48443 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXRGP48443 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXRGP48443 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXRGP48443 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms