Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL1P47992 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCL1P47992 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL1P47992 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL1P47992 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCL1P47992 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCL1P47992 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCL1P47992 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCL1P47992 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCL1P47992 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCL1P47992 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL1P47992 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms