Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTX2P47972 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms