Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRB2P47870 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms