Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPD2P43304 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPD2P43304 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPD2P43304 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPD2P43304 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPD2P43304 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPD2P43304 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPD2P43304 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPD2P43304 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPD2P43304 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPD2P43304 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPD2P43304 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPD2P43304 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPD2P43304 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPD2P43304 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPD2P43304 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPD2P43304 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPD2P43304 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPD2P43304 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPD2P43304 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPD2P43304 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPD2P43304 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPD2P43304 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPD2P43304 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPD2P43304 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPD2P43304 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPD2P43304 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPD2P43304 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPD2P43304 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPD2P43304 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPD2P43304 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPD2P43304 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPD2P43304 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms