Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV4P43268 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV4P43268 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV4P43268 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV4P43268 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV4P43268 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ETV4P43268 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ETV4P43268 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ETV4P43268 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ETV4P43268 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ETV4P43268 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV4P43268 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV4P43268 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV4P43268 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETV4P43268 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETV4P43268 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETV4P43268 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ETV4P43268 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETV4P43268 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV4P43268 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV4P43268 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV4P43268 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV4P43268 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV4P43268 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV4P43268 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV4P43268 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ETV4P43268 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV4P43268 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV4P43268 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV4P43268 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV4P43268 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV4P43268 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV4P43268 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV4P43268 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV4P43268 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV4P43268 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV4P43268 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV4P43268 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV4P43268 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV4P43268 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV4P43268 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms