Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPHP41219 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPHP41219 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPHP41219 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPHP41219 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPHP41219 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPHP41219 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPHP41219 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPHP41219 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPHP41219 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPHP41219 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPHP41219 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPHP41219 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPHP41219 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPHP41219 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPHP41219 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPHP41219 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPHP41219 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPHP41219 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPHP41219 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPHP41219 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPHP41219 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPHP41219 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPHP41219 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPHP41219 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPHP41219 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPHP41219 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPHP41219 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPHP41219 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPHP41219 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPHP41219 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPHP41219 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPHP41219 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPHP41219 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPHP41219 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPHP41219 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPHP41219 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPHP41219 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPHP41219 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPHP41219 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPHP41219 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPHP41219 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPHP41219 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPHP41219 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPHP41219 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPHP41219 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPHP41219 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms