Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms