Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHI3L1P36222 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHI3L1P36222 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHI3L1P36222 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHI3L1P36222 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHI3L1P36222 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHI3L1P36222 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHI3L1P36222 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHI3L1P36222 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHI3L1P36222 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHI3L1P36222 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms