Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX11P35716 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX11P35716 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX11P35716 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX11P35716 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX11P35716 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX11P35716 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX11P35716 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX11P35716 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms