Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms