Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC1P35251 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC1P35251 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFC1P35251 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFC1P35251 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFC1P35251 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RFC1P35251 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFC1P35251 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFC1P35251 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFC1P35251 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms