Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFTPDP35247 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms