Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMI1P35226 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMI1P35226 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMI1P35226 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BMI1P35226 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BMI1P35226 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BMI1P35226 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BMI1P35226 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BMI1P35226 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BMI1P35226 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BMI1P35226 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BMI1P35226 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BMI1P35226 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BMI1P35226 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BMI1P35226 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BMI1P35226 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BMI1P35226 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BMI1P35226 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMI1P35226 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMI1P35226 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMI1P35226 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMI1P35226 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms