Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFNP31947 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFNP31947 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFNP31947 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SFNP31947 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFNP31947 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFNP31947 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFNP31947 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFNP31947 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFNP31947 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFNP31947 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFNP31947 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFNP31947 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFNP31947 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFNP31947 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFNP31947 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFNP31947 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFNP31947 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFNP31947 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFNP31947 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFNP31947 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFNP31947 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFNP31947 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFNP31947 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFNP31947 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFNP31947 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFNP31947 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFNP31947 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFNP31947 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFNP31947 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFNP31947 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFNP31947 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFNP31947 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFNP31947 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFNP31947 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFNP31947 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFNP31947 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFNP31947 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFNP31947 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SFNP31947 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFNP31947 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFNP31947 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFNP31947 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFNP31947 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFNP31947 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFNP31947 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFNP31947 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms