Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CASQ1P31415 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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CASQ1P31415 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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CASQ1P31415 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ1P31415 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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