Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5DP30049 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms