Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS1P28331 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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