Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARK3P27448 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARK3P27448 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARK3P27448 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK3P27448 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK3P27448 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK3P27448 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK3P27448 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK3P27448 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK3P27448 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK3P27448 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK3P27448 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK3P27448 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK3P27448 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK3P27448 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK3P27448 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK3P27448 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK3P27448 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARK3P27448 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARK3P27448 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK3P27448 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK3P27448 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK3P27448 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK3P27448 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK3P27448 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK3P27448 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK3P27448 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK3P27448 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms