Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTFRP26992 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms