Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VARSP26640 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VARSP26640 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VARSP26640 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VARSP26640 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VARSP26640 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VARSP26640 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VARSP26640 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VARSP26640 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VARSP26640 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VARSP26640 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VARSP26640 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VARSP26640 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VARSP26640 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VARSP26640 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VARSP26640 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VARSP26640 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VARSP26640 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VARSP26640 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VARSP26640 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VARSP26640 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VARSP26640 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VARSP26640 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VARSP26640 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VARSP26640 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VARSP26640 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VARSP26640 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VARSP26640 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VARSP26640 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VARSP26640 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VARSP26640 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VARSP26640 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VARSP26640 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VARSP26640 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VARSP26640 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VARSP26640 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VARSP26640 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VARSP26640 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VARSP26640 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VARSP26640 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VARSP26640 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VARSP26640 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms