Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms