Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA4P25789 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms