Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYF6P23409 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYF6P23409 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYF6P23409 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MYF6P23409 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYF6P23409 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYF6P23409 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYF6P23409 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYF6P23409 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYF6P23409 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MYF6P23409 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MYF6P23409 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MYF6P23409 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MYF6P23409 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYF6P23409 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYF6P23409 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYF6P23409 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYF6P23409 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYF6P23409 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYF6P23409 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYF6P23409 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYF6P23409 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYF6P23409 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYF6P23409 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYF6P23409 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms